Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msx3P70354 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msx3P70354 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms