Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gfi1P70338 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gfi1P70338 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms