Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux2P70298 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux2P70298 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cux2P70298 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cux2P70298 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Cux2P70298 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Cux2P70298 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cux2P70298 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms