Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tgif1P70284 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tgif1P70284 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms