Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp7P70280 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp7P70280 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms