Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SbdsP70122 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SbdsP70122 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SbdsP70122 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms