Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acta1P68134 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acta1P68134 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acta1P68134 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms