Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Barhl1P63157 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Barhl1P63157 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms