Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Polr2lP62876 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms