Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rab3cP62823 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab3cP62823 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms