Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Snrpd1P62315 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Snrpd1P62315 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms