Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psme3P61290 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Psme3P61290 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Psme3P61290 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms