Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2fP61219 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Polr2fP61219 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms