Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Arf3P61205 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Arf3P61205 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms