Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ActbP60710 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ActbP60710 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ActbP60710 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ActbP60710 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ActbP60710 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ActbP60710 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ActbP60710 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ActbP60710 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ActbP60710 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ActbP60710 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ActbP60710 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ActbP60710 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ActbP60710 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ActbP60710 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ActbP60710 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ActbP60710 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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