Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Setd4P58467 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Setd4P58467 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms