Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PtpaP58389 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PtpaP58389 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms