Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dpf3P58269 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dpf3P58269 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms