Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CtnsP57757 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtnsP57757 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms