Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcbp4P57724 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcbp4P57724 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms