Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Lim2P56563 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lim2P56563 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Lim2P56563 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms