Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp5P56399 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Usp5P56399 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms