Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdkn2bP55271 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdkn2bP55271 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms