Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbtP53395 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbtP53395 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DbtP53395 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DbtP53395 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DbtP53395 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbtP53395 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbtP53395 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbtP53395 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbtP53395 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbtP53395 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DbtP53395 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DbtP53395 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DbtP53395 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DbtP53395 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DbtP53395 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms