Protein–RNA interactions for Protein: P52825

Cpt2, Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt2P52825 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpt2P52825 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms