Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Upp1P52624 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Upp1P52624 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms