Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube2e3P52483 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ube2e3P52483 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms