Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pold1P52431 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pold1P52431 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms