Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ClgnP52194 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms