Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec1P51908 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Apobec1P51908 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms