Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccr4P51680 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms