Protein–RNA interactions for Protein: P51125

Cast, Calpastatin, mousemouse

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Length 788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CastP51125 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CastP51125 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CastP51125 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CastP51125 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CastP51125 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CastP51125 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CastP51125 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CastP51125 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CastP51125 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CastP51125 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CastP51125 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CastP51125 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CastP51125 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CastP51125 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CastP51125 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CastP51125 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms