Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb1P50571 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gabrb1P50571 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabrb1P50571 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms