Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SftpdP50404 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SftpdP50404 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SftpdP50404 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms