Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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BckdhaP50136 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BckdhaP50136 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BckdhaP50136 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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