Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cav1P49817 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms