Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hcls1P49710 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hcls1P49710 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms