Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Epb42P49222 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms