Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CitP49025 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CitP49025 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CitP49025 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CitP49025 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CitP49025 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CitP49025 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CitP49025 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms