Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GdnfP48540 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GdnfP48540 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms