Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TgfaP48030 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TgfaP48030 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TgfaP48030 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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