Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl5P47962 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl5P47962 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms