Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab11bP46638 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab11bP46638 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab11bP46638 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab11bP46638 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms