Protein–RNA interactions for Protein: P46062

Sipa1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1P46062 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sipa1P46062 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sipa1P46062 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms