Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ItgavP43406 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms