Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tlx1P43345 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tlx1P43345 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms