Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cox6a1P43024 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cox6a1P43024 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms