Protein–RNA interactions for Protein: P42128

Foxk1, Forkhead box protein K1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxk1P42128 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxk1P42128 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms