Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfsf9P41274 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfsf9P41274 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms