Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fen1P39749 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fen1P39749 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fen1P39749 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms